Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF138P52744 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF138P52744 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF138P52744 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF138P52744 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms