Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2A1P52655 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1P52655 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1P52655 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms