Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1GP51170 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1GP51170 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCNN1GP51170 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1GP51170 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms