Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASPP50552 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASPP50552 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASPP50552 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASPP50552 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VASPP50552 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VASPP50552 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VASPP50552 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VASPP50552 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VASPP50552 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VASPP50552 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VASPP50552 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VASPP50552 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VASPP50552 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VASPP50552 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VASPP50552 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VASPP50552 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VASPP50552 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VASPP50552 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VASPP50552 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VASPP50552 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VASPP50552 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VASPP50552 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VASPP50552 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VASPP50552 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VASPP50552 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VASPP50552 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VASPP50552 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VASPP50552 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VASPP50552 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VASPP50552 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VASPP50552 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VASPP50552 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VASPP50552 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VASPP50552 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VASPP50552 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VASPP50552 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VASPP50552 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VASPP50552 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VASPP50552 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VASPP50552 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VASPP50552 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VASPP50552 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VASPP50552 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VASPP50552 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VASPP50552 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VASPP50552 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VASPP50552 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VASPP50552 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VASPP50552 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VASPP50552 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VASPP50552 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VASPP50552 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VASPP50552 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VASPP50552 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VASPP50552 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VASPP50552 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VASPP50552 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VASPP50552 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VASPP50552 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VASPP50552 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VASPP50552 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms