Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CTCFP49711 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTCFP49711 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTCFP49711 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTCFP49711 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTCFP49711 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTCFP49711 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTCFP49711 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTCFP49711 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CTCFP49711 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTCFP49711 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTCFP49711 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTCFP49711 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTCFP49711 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTCFP49711 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTCFP49711 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTCFP49711 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTCFP49711 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTCFP49711 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CTCFP49711 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTCFP49711 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTCFP49711 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CTCFP49711 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTCFP49711 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTCFP49711 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTCFP49711 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTCFP49711 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTCFP49711 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTCFP49711 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTCFP49711 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTCFP49711 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTCFP49711 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTCFP49711 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTCFP49711 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTCFP49711 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTCFP49711 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTCFP49711 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTCFP49711 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTCFP49711 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTCFP49711 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTCFP49711 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTCFP49711 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTCFP49711 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CTCFP49711 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CTCFP49711 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTCFP49711 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTCFP49711 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTCFP49711 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTCFP49711 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTCFP49711 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTCFP49711 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTCFP49711 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTCFP49711 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTCFP49711 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTCFP49711 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTCFP49711 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTCFP49711 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTCFP49711 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTCFP49711 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTCFP49711 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms