Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCP4P48539 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCP4P48539 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCP4P48539 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCP4P48539 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCP4P48539 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCP4P48539 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCP4P48539 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCP4P48539 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCP4P48539 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCP4P48539 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCP4P48539 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCP4P48539 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCP4P48539 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCP4P48539 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCP4P48539 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCP4P48539 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCP4P48539 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCP4P48539 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCP4P48539 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCP4P48539 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCP4P48539 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCP4P48539 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCP4P48539 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCP4P48539 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCP4P48539 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCP4P48539 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCP4P48539 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCP4P48539 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCP4P48539 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCP4P48539 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCP4P48539 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCP4P48539 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCP4P48539 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCP4P48539 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCP4P48539 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCP4P48539 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms