Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XCR1P46094 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XCR1P46094 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XCR1P46094 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XCR1P46094 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XCR1P46094 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XCR1P46094 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XCR1P46094 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XCR1P46094 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XCR1P46094 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XCR1P46094 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XCR1P46094 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XCR1P46094 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XCR1P46094 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XCR1P46094 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XCR1P46094 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XCR1P46094 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XCR1P46094 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XCR1P46094 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XCR1P46094 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XCR1P46094 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XCR1P46094 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XCR1P46094 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XCR1P46094 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XCR1P46094 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XCR1P46094 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XCR1P46094 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XCR1P46094 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XCR1P46094 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XCR1P46094 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XCR1P46094 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XCR1P46094 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XCR1P46094 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XCR1P46094 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XCR1P46094 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XCR1P46094 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XCR1P46094 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XCR1P46094 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XCR1P46094 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XCR1P46094 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XCR1P46094 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XCR1P46094 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XCR1P46094 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XCR1P46094 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XCR1P46094 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XCR1P46094 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XCR1P46094 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XCR1P46094 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XCR1P46094 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XCR1P46094 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XCR1P46094 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XCR1P46094 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XCR1P46094 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XCR1P46094 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XCR1P46094 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XCR1P46094 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XCR1P46094 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XCR1P46094 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XCR1P46094 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XCR1P46094 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XCR1P46094 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms