Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGFRP43088 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGFRP43088 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms