Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC1A4P43007 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC1A4P43007 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC1A4P43007 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms