Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA3P42263 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA3P42263 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms