Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA1P42261 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA1P42261 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA1P42261 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA1P42261 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIA1P42261 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA1P42261 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms