Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL13AP40429 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL13AP40429 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL13AP40429 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL13AP40429 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL13AP40429 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms