Protein–RNA interactions for Protein: P40238

MPL, Thrombopoietin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPLP40238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MPLP40238 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MPLP40238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MPLP40238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MPLP40238 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MPLP40238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MPLP40238 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MPLP40238 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MPLP40238 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MPLP40238 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MPLP40238 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MPLP40238 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MPLP40238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MPLP40238 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MPLP40238 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MPLP40238 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MPLP40238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MPLP40238 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MPLP40238 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MPLP40238 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MPLP40238 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MPLP40238 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MPLP40238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MPLP40238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MPLP40238 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MPLP40238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MPLP40238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MPLP40238 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MPLP40238 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MPLP40238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MPLP40238 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MPLP40238 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MPLP40238 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MPLP40238 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MPLP40238 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MPLP40238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MPLP40238 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MPLP40238 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MPLP40238 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MPLP40238 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MPLP40238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MPLP40238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MPLP40238 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MPLP40238 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MPLP40238 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MPLP40238 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MPLP40238 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MPLP40238 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MPLP40238 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MPLP40238 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MPLP40238 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MPLP40238 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MPLP40238 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MPLP40238 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MPLP40238 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MPLP40238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MPLP40238 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MPLP40238 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MPLP40238 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MPLP40238 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MPLP40238 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MPLP40238 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MPLP40238 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MPLP40238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MPLP40238 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MPLP40238 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MPLP40238 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MPLP40238 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MPLP40238 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MPLP40238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MPLP40238 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MPLP40238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MPLP40238 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms