Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINF1P36955 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINF1P36955 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms