Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms