Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR2P33947 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR2P33947 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms