Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC8A1P32418 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A1P32418 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms