Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKARP32238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKARP32238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKARP32238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKARP32238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKARP32238 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKARP32238 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKARP32238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKARP32238 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKARP32238 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKARP32238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKARP32238 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKARP32238 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKARP32238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKARP32238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKARP32238 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKARP32238 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKARP32238 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKARP32238 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKARP32238 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKARP32238 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCKARP32238 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCKARP32238 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCKARP32238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCKARP32238 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKARP32238 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKARP32238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKARP32238 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKARP32238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKARP32238 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKARP32238 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKARP32238 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKARP32238 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKARP32238 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKARP32238 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKARP32238 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKARP32238 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKARP32238 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKARP32238 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKARP32238 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKARP32238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKARP32238 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKARP32238 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKARP32238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKARP32238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKARP32238 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKARP32238 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKARP32238 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCKARP32238 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCKARP32238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms