Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPOP30536 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPOP30536 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPOP30536 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPOP30536 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSPOP30536 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSPOP30536 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSPOP30536 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSPOP30536 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPOP30536 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPOP30536 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSPOP30536 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSPOP30536 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSPOP30536 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSPOP30536 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPOP30536 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPOP30536 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPOP30536 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPOP30536 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSPOP30536 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPOP30536 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPOP30536 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSPOP30536 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPOP30536 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPOP30536 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPOP30536 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPOP30536 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPOP30536 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPOP30536 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms