Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNGA1P29973 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGA1P29973 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms