Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA2P29317 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHA2P29317 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA2P29317 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms