Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK6P29122 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK6P29122 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK6P29122 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms