Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF8P28908 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF8P28908 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms