Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRMP28827 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRMP28827 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PTPRMP28827 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms