Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD1P28289 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD1P28289 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD1P28289 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms