Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1BP28222 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1BP28222 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms