Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB6P28072 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB6P28072 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB6P28072 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB6P28072 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms