Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA3P26006 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA3P26006 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms