Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTAFRP25105 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTAFRP25105 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTAFRP25105 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms