Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCHP24723 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCHP24723 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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