Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLDCP23378 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLDCP23378 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLDCP23378 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GLDCP23378 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLDCP23378 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLDCP23378 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLDCP23378 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLDCP23378 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLDCP23378 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLDCP23378 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GLDCP23378 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLDCP23378 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GLDCP23378 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLDCP23378 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLDCP23378 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GLDCP23378 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLDCP23378 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLDCP23378 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLDCP23378 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLDCP23378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLDCP23378 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GLDCP23378 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLDCP23378 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLDCP23378 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GLDCP23378 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLDCP23378 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLDCP23378 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLDCP23378 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLDCP23378 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLDCP23378 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLDCP23378 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLDCP23378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLDCP23378 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLDCP23378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLDCP23378 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLDCP23378 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLDCP23378 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLDCP23378 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLDCP23378 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLDCP23378 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GLDCP23378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLDCP23378 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLDCP23378 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLDCP23378 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLDCP23378 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLDCP23378 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLDCP23378 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLDCP23378 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLDCP23378 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLDCP23378 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLDCP23378 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLDCP23378 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLDCP23378 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLDCP23378 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GLDCP23378 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLDCP23378 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLDCP23378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLDCP23378 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLDCP23378 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GLDCP23378 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLDCP23378 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLDCP23378 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLDCP23378 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLDCP23378 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLDCP23378 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLDCP23378 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLDCP23378 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLDCP23378 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms