Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMPD1P23109 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
AMPD1P23109 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPD1P23109 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPD1P23109 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms