Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA4P22748 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA4P22748 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CA4P22748 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CA4P22748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA4P22748 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA4P22748 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA4P22748 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA4P22748 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA4P22748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA4P22748 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA4P22748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CA4P22748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CA4P22748 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CA4P22748 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA4P22748 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CA4P22748 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA4P22748 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA4P22748 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA4P22748 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CA4P22748 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CA4P22748 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA4P22748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA4P22748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA4P22748 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA4P22748 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA4P22748 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA4P22748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA4P22748 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA4P22748 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA4P22748 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA4P22748 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA4P22748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA4P22748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA4P22748 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA4P22748 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA4P22748 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CA4P22748 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CA4P22748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CA4P22748 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CA4P22748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CA4P22748 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA4P22748 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA4P22748 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA4P22748 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA4P22748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA4P22748 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA4P22748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA4P22748 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA4P22748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CA4P22748 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CA4P22748 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CA4P22748 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CA4P22748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CA4P22748 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA4P22748 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA4P22748 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA4P22748 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA4P22748 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA4P22748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CA4P22748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CA4P22748 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CA4P22748 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA4P22748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA4P22748 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA4P22748 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA4P22748 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA4P22748 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA4P22748 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA4P22748 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA4P22748 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA4P22748 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms