Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB5AP20339 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB5AP20339 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms