Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRMP19623 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRMP19623 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRMP19623 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRMP19623 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRMP19623 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRMP19623 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRMP19623 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRMP19623 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRMP19623 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRMP19623 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRMP19623 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRMP19623 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRMP19623 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRMP19623 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRMP19623 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRMP19623 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRMP19623 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRMP19623 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRMP19623 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRMP19623 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRMP19623 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRMP19623 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRMP19623 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRMP19623 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRMP19623 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRMP19623 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRMP19623 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRMP19623 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRMP19623 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRMP19623 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRMP19623 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRMP19623 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRMP19623 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRMP19623 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRMP19623 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRMP19623 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRMP19623 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRMP19623 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRMP19623 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRMP19623 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRMP19623 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRMP19623 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRMP19623 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRMP19623 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRMP19623 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRMP19623 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRMP19623 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRMP19623 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRMP19623 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRMP19623 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRMP19623 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRMP19623 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRMP19623 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRMP19623 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRMP19623 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRMP19623 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRMP19623 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRMP19623 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRMP19623 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRMP19623 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRMP19623 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms