Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCLP19338 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NCLP19338 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCLP19338 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCLP19338 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCLP19338 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCLP19338 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCLP19338 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCLP19338 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCLP19338 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NCLP19338 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCLP19338 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCLP19338 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCLP19338 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCLP19338 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCLP19338 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCLP19338 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCLP19338 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NCLP19338 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCLP19338 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCLP19338 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCLP19338 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCLP19338 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCLP19338 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NCLP19338 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCLP19338 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCLP19338 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCLP19338 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCLP19338 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCLP19338 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCLP19338 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NCLP19338 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCLP19338 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCLP19338 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCLP19338 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCLP19338 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCLP19338 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCLP19338 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCLP19338 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCLP19338 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCLP19338 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCLP19338 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCLP19338 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCLP19338 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCLP19338 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCLP19338 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCLP19338 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCLP19338 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCLP19338 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCLP19338 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCLP19338 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCLP19338 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCLP19338 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCLP19338 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCLP19338 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCLP19338 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCLP19338 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCLP19338 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCLP19338 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCLP19338 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCLP19338 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCLP19338 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCLP19338 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCLP19338 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCLP19338 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCLP19338 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCLP19338 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCLP19338 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCLP19338 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCLP19338 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCLP19338 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCLP19338 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCLP19338 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCLP19338 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCLP19338 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCLP19338 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCLP19338 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCLP19338 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCLP19338 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCLP19338 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms