Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT4P19013 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT4P19013 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT4P19013 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT4P19013 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT4P19013 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT4P19013 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT4P19013 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT4P19013 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT4P19013 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT4P19013 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT4P19013 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT4P19013 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT4P19013 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT4P19013 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT4P19013 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT4P19013 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT4P19013 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT4P19013 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT4P19013 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT4P19013 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT4P19013 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT4P19013 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT4P19013 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT4P19013 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT4P19013 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT4P19013 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT4P19013 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT4P19013 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT4P19013 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT4P19013 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT4P19013 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT4P19013 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT4P19013 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT4P19013 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT4P19013 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT4P19013 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT4P19013 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT4P19013 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT4P19013 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT4P19013 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT4P19013 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT4P19013 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT4P19013 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT4P19013 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT4P19013 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT4P19013 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT4P19013 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT4P19013 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT4P19013 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT4P19013 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT4P19013 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT4P19013 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT4P19013 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT4P19013 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT4P19013 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT4P19013 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT4P19013 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT4P19013 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT4P19013 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT4P19013 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT4P19013 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT4P19013 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT4P19013 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT4P19013 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT4P19013 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms