Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF6P18850 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF6P18850 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF6P18850 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF6P18850 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF6P18850 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF6P18850 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF6P18850 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF6P18850 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF6P18850 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF6P18850 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF6P18850 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF6P18850 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF6P18850 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF6P18850 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF6P18850 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF6P18850 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF6P18850 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF6P18850 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF6P18850 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF6P18850 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF6P18850 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF6P18850 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF6P18850 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF6P18850 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF6P18850 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF6P18850 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF6P18850 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF6P18850 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATF6P18850 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF6P18850 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF6P18850 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF6P18850 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF6P18850 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF6P18850 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6P18850 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6P18850 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6P18850 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6P18850 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6P18850 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6P18850 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF6P18850 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF6P18850 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF6P18850 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF6P18850 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF6P18850 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF6P18850 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF6P18850 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF6P18850 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF6P18850 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ATF6P18850 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF6P18850 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF6P18850 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF6P18850 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF6P18850 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF6P18850 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF6P18850 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF6P18850 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF6P18850 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF6P18850 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms