Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF3P18847 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF3P18847 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF3P18847 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF3P18847 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATF3P18847 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ATF3P18847 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATF3P18847 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF3P18847 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF3P18847 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ATF3P18847 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ATF3P18847 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATF3P18847 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATF3P18847 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATF3P18847 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATF3P18847 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATF3P18847 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATF3P18847 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATF3P18847 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATF3P18847 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATF3P18847 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATF3P18847 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATF3P18847 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATF3P18847 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATF3P18847 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATF3P18847 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATF3P18847 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATF3P18847 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATF3P18847 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATF3P18847 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATF3P18847 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATF3P18847 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATF3P18847 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATF3P18847 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATF3P18847 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATF3P18847 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATF3P18847 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATF3P18847 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATF3P18847 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ATF3P18847 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATF3P18847 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATF3P18847 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATF3P18847 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATF3P18847 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ATF3P18847 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATF3P18847 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATF3P18847 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATF3P18847 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATF3P18847 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATF3P18847 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATF3P18847 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATF3P18847 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATF3P18847 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATF3P18847 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATF3P18847 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATF3P18847 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATF3P18847 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATF3P18847 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATF3P18847 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATF3P18847 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATF3P18847 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATF3P18847 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATF3P18847 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ATF3P18847 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATF3P18847 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATF3P18847 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATF3P18847 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATF3P18847 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATF3P18847 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ATF3P18847 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ATF3P18847 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATF3P18847 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ATF3P18847 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATF3P18847 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATF3P18847 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATF3P18847 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ATF3P18847 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF3P18847 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF3P18847 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF3P18847 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF3P18847 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF3P18847 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATF3P18847 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATF3P18847 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATF3P18847 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ATF3P18847 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATF3P18847 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATF3P18847 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF3P18847 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF3P18847 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF3P18847 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF3P18847 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATF3P18847 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms