Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC2P18074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC2P18074 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC2P18074 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms