Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMPD1P17405 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMPD1P17405 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMPD1P17405 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMPD1P17405 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms