Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF43P17038 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF43P17038 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.1 ms