Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB1P16220 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB1P16220 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB1P16220 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB1P16220 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB1P16220 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB1P16220 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB1P16220 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB1P16220 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB1P16220 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB1P16220 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB1P16220 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB1P16220 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB1P16220 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB1P16220 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB1P16220 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB1P16220 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB1P16220 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB1P16220 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB1P16220 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB1P16220 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB1P16220 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB1P16220 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB1P16220 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB1P16220 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB1P16220 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB1P16220 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB1P16220 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB1P16220 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB1P16220 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB1P16220 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB1P16220 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB1P16220 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB1P16220 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB1P16220 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB1P16220 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB1P16220 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB1P16220 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB1P16220 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB1P16220 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB1P16220 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB1P16220 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB1P16220 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB1P16220 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB1P16220 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB1P16220 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB1P16220 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB1P16220 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB1P16220 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB1P16220 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB1P16220 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB1P16220 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB1P16220 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB1P16220 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB1P16220 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB1P16220 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB1P16220 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB1P16220 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB1P16220 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB1P16220 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB1P16220 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB1P16220 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB1P16220 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB1P16220 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB1P16220 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB1P16220 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB1P16220 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB1P16220 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB1P16220 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB1P16220 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB1P16220 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms