Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GSPT1P15170 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GSPT1P15170 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GSPT1P15170 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSPT1P15170 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms