Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA3P15088 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA3P15088 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA3P15088 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA3P15088 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA3P15088 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA3P15088 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA3P15088 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA3P15088 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA3P15088 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA3P15088 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA3P15088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA3P15088 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA3P15088 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA3P15088 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA3P15088 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA3P15088 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA3P15088 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA3P15088 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA3P15088 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA3P15088 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA3P15088 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA3P15088 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA3P15088 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA3P15088 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA3P15088 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA3P15088 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA3P15088 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA3P15088 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA3P15088 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA3P15088 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA3P15088 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA3P15088 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA3P15088 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA3P15088 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA3P15088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA3P15088 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA3P15088 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA3P15088 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA3P15088 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA3P15088 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA3P15088 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA3P15088 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA3P15088 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA3P15088 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA3P15088 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA3P15088 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA3P15088 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA3P15088 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA3P15088 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA3P15088 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA3P15088 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA3P15088 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA3P15088 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA3P15088 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA3P15088 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA3P15088 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA3P15088 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA3P15088 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA3P15088 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA3P15088 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA3P15088 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA3P15088 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA3P15088 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA3P15088 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA3P15088 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA3P15088 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms