Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRF1P14222 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRF1P14222 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRF1P14222 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRF1P14222 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRF1P14222 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRF1P14222 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRF1P14222 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRF1P14222 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRF1P14222 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRF1P14222 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRF1P14222 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRF1P14222 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRF1P14222 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRF1P14222 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRF1P14222 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRF1P14222 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRF1P14222 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRF1P14222 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRF1P14222 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRF1P14222 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRF1P14222 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRF1P14222 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRF1P14222 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRF1P14222 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRF1P14222 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRF1P14222 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRF1P14222 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRF1P14222 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRF1P14222 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRF1P14222 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRF1P14222 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRF1P14222 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRF1P14222 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRF1P14222 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRF1P14222 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRF1P14222 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRF1P14222 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRF1P14222 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRF1P14222 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRF1P14222 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRF1P14222 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRF1P14222 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRF1P14222 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRF1P14222 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRF1P14222 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRF1P14222 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRF1P14222 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRF1P14222 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRF1P14222 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRF1P14222 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRF1P14222 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRF1P14222 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRF1P14222 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms