Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOBP13765 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOBP13765 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DOBP13765 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DOBP13765 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DOBP13765 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOBP13765 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOBP13765 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DOBP13765 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms