Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCG2P13521 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCG2P13521 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCG2P13521 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCG2P13521 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCG2P13521 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCG2P13521 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCG2P13521 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCG2P13521 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCG2P13521 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCG2P13521 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCG2P13521 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCG2P13521 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCG2P13521 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCG2P13521 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG2P13521 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG2P13521 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG2P13521 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG2P13521 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG2P13521 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG2P13521 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCG2P13521 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCG2P13521 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCG2P13521 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCG2P13521 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCG2P13521 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCG2P13521 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCG2P13521 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCG2P13521 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCG2P13521 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCG2P13521 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCG2P13521 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCG2P13521 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCG2P13521 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCG2P13521 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG2P13521 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCG2P13521 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCG2P13521 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCG2P13521 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCG2P13521 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCG2P13521 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCG2P13521 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCG2P13521 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCG2P13521 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCG2P13521 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG2P13521 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCG2P13521 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCG2P13521 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCG2P13521 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCG2P13521 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCG2P13521 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCG2P13521 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCG2P13521 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCG2P13521 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCG2P13521 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCG2P13521 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCG2P13521 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCG2P13521 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCG2P13521 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCG2P13521 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCG2P13521 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCG2P13521 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCG2P13521 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCG2P13521 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG2P13521 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG2P13521 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG2P13521 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG2P13521 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG2P13521 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCG2P13521 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCG2P13521 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCG2P13521 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCG2P13521 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCG2P13521 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCG2P13521 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCG2P13521 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG2P13521 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms