Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL4P13236 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL4P13236 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL4P13236 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL4P13236 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL4P13236 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL4P13236 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL4P13236 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL4P13236 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL4P13236 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL4P13236 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL4P13236 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL4P13236 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL4P13236 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL4P13236 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL4P13236 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL4P13236 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL4P13236 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL4P13236 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL4P13236 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL4P13236 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL4P13236 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL4P13236 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL4P13236 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL4P13236 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL4P13236 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL4P13236 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL4P13236 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL4P13236 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL4P13236 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL4P13236 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL4P13236 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL4P13236 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL4P13236 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL4P13236 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL4P13236 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL4P13236 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL4P13236 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL4P13236 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL4P13236 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL4P13236 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL4P13236 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL4P13236 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL4P13236 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL4P13236 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL4P13236 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL4P13236 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL4P13236 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL4P13236 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL4P13236 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL4P13236 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL4P13236 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL4P13236 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms