Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH1P12830 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH1P12830 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH1P12830 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH1P12830 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH1P12830 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH1P12830 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH1P12830 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH1P12830 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH1P12830 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH1P12830 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH1P12830 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH1P12830 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH1P12830 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH1P12830 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH1P12830 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH1P12830 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH1P12830 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH1P12830 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH1P12830 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH1P12830 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH1P12830 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH1P12830 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH1P12830 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH1P12830 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH1P12830 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH1P12830 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH1P12830 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH1P12830 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH1P12830 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH1P12830 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH1P12830 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH1P12830 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH1P12830 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH1P12830 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH1P12830 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH1P12830 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH1P12830 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH1P12830 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH1P12830 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH1P12830 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH1P12830 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH1P12830 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH1P12830 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH1P12830 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH1P12830 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH1P12830 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH1P12830 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH1P12830 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH1P12830 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH1P12830 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH1P12830 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms