Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL6A2P12110 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL6A2P12110 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms